Мега-Бонус должен ускорять время производства, но оно длится столько же, сколько и без бонуса!

Пожалуйста, обратите внимание на принцип работы бонуса, который представлен в его описаниии: он ускоряет время производства, а не сокращает его. 
Таким образом, при использовании бонуса таймер на производстве все так же будет показывать, например, 4 часа. Однако, эти 4 часа пройдут гораздо быстрее, чем 4 обычных астрономических часа, т.к. время на таймере будет отсчитываться в ускоренном режиме. В итоге производство все равно займет меньше времени при применении бонуса!